故事发生在世界上屈指可数的高科技城市“TOKYO城”。警视厅搜查一课的青年搜查官——主人公神崎贤，是署内首屈一指的射击高手。有一天，贤接受到世界级财阀“财前コンツェルン”的宴会的保护命令，贤因为要保护这样的大人物而感到紧张。但是，宴会会场突然出现了奇怪的机器人！财前因此丧命，贤与他的儿子纯也受到了濒死的重伤。接着，晚会的主宾赛车手亚栗亮、蒙面摔跤运动员豪田刚同样受了重伤。三名年轻人就这样徘徊在死亡的深渊中……这之后，几天过去了。

东京湾出现的谜之组织“伊特”率领机器人军团出现，警察和军队都拿它们没办法。这时，穿着机械服的三名年轻人出现了！他们正是苏醒了的机器人搜查官“装甲警察METAL JACK”。

凭着“JACK SUIT”和“JACK ARMOR”，在华丽的“METAL JACK”的活跃下，机器人军团被彻底粉碎，“METAL JACK”漂亮的用胜利装点了战斗。